chromatyna.pdf

(2124 KB) Pobierz
31152415 UNPDF
transkrypcja chromatyny
problem:
Jak to moż e dzia
e dzia ł łać:
dysocjacja
histonów?
kompleks pol II RNA
500 kD +
skip:
NO
split:
NO
nukleosom:
145 bp DNA = 100 kD
rdzeń histonowy = 100 kD
strip:
YES
Skip czy Split czy Strip
?
Thoma 1991 Trends Genet 7: 175
Jak to mo
31152415.016.png 31152415.017.png 31152415.018.png
skip ?
Jak by to się mog
mog ł ł o dzia
o dziać?
przesuwanie się
wzdłuż pętli DNA
Studitsky, Clark, Felsenfeld 1974 Cell 76, 371
tak działa pol III RNA i fagowe pol RNA
(także zależne od ATP kompleksy remodelujące)
Studitsky i in. 2004 Trends Bioch Sci 29: 127-135
Jak by to si
31152415.019.png 31152415.001.png 31152415.002.png 31152415.003.png 31152415.004.png 31152415.005.png 31152415.006.png
split ?
Jak by to się mog
mog ł ł o dzia
o dziać?
Transcription
- +
w ME transkrybowana chromatyna wydaje się być „gładka”
(o jednakowej grubości), nić jest grubsza niż gołe DNA,
przeciwciała wykrywają obecność histonów
czy to są artefakty?
kb
3.53
+ 3.5kb
+3 .0kb
2.03
1.58
a
+2 .5kb
1.33
0.98
+2 .0kb
transkrypcja eksponuje dwie normalnie ukryte reszty
cysteinowe H3 na działanie czynników modyfikujących
i chromatografię powinowactwa Hg
mononukleosomy wydają się być niesfałdowane w postaci
dwu tetramerów histonów + nieduże białka niehistonowe
0.82
w transkrybowanej chroma-
tynie po trawieniu DNazą I
pojawiają się powtórzenia
połówek nukleosomów
Prior & Allfrey 1983 Cell 34, 1a0a33a
Lee & Garrard 1991 EMBO J. 10, 607
powolna transkrypcja przez pol II RNA powoduje wyparcie z nukleosomu
jednego dimeru H2A-H2B Studitsky i in. 2004 Trends Bioch Sci 29: 127-135
Jak by to si
31152415.007.png 31152415.008.png 31152415.009.png 31152415.010.png
strip ?
synteza histonów
obrót histonów
problem: które histony są dostępne do tworzenia nukleosomów ?
mitoza
zależne od replikacji
faza
G 2
faza
G
konstytutywne
zastępcze histony
faza S
M faza G 1
faza S
faza G 2
M
u wszystkich eukariota H3.3, u roślin wysoce zacetylowany H3.2
aktywna transkrypcja przez pol II RNA powoduje rozpad nukleosomów
Kulaeva i in. 2007 Mutat Res 618: 116-129
31152415.011.png 31152415.012.png 31152415.013.png
dynamika struktury
chromatyny
• w obrębie wysp CpG jest zależna od stanu metylacji DNA
• modyfikacje histonów - „kod histonowy”
• remodelowanie chromatyny
* zależne od ATP
* niekiedy za pośrednictwem interferencji RNA (RNAi)
NOBEL 2006 !
przykłady zależnej od RNA heterochromatynizacji:
- wyciszenie centromerów i loci typu koniugacyjnego u droż-
dży rozszczepkowych Schizosaccharomycespombe
- inaktywacja piętnowanego chromosomu X (Xi),
 
31152415.014.png 31152415.015.png

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika:

Zgłoś jeśli naruszono regulamin