chromatyna(1).pdf

transkrypcja chromatyny

problem:

Jak to moż e dzia

e dzia ł łać:

dysocjacja

histonów?

kompleks pol II RNA

500 kD +

skip:

split:

nukleosom:

145 bp DNA = 100 kD

rdzeń histonowy = 100 kD

strip:

YES

Skip czy Split czy Strip

Thoma 1991 Trends Genet 7: 175

Jak to mo

skip ?

Jak by to się mog

mog ł ł o dzia

o dziać?

przesuwanie się

wzdłuż pętli DNA

Studitsky, Clark, Felsenfeld 1974 Cell 76, 371

tak działa pol III RNA i fagowe pol RNA

(także zależne od ATP kompleksy remodelujące)

Studitsky i in. 2004 Trends Bioch Sci 29: 127-135

Jak by to si

split ?

Jak by to się mog

mog ł ł o dzia

o dziać?

Transcription

- +

w ME transkrybowana chromatyna wydaje się być „gładka”

(o jednakowej grubości), nić jest grubsza niż gołe DNA,

przeciwciała wykrywają obecność histonów

czy to są artefakty?

3.53

+ 3.5kb

+3 .0kb

2.03

1.58

+2 .5kb

1.33

0.98

+2 .0kb

transkrypcja eksponuje dwie normalnie ukryte reszty

cysteinowe H3 na działanie czynników modyfikujących

i chromatografię powinowactwa Hg

mononukleosomy wydają się być niesfałdowane w postaci

dwu tetramerów histonów + nieduże białka niehistonowe

0.82

w transkrybowanej chroma-

tynie po trawieniu DNazą I

pojawiają się powtórzenia

połówek nukleosomów

Prior & Allfrey 1983 Cell 34, 1a0a33a

Lee & Garrard 1991 EMBO J. 10, 607

powolna transkrypcja przez pol II RNA powoduje wyparcie z nukleosomu

jednego dimeru H2A-H2B Studitsky i in. 2004 Trends Bioch Sci 29: 127-135

Jak by to si

strip ?

synteza histonów

obrót histonów

problem: które histony są dostępne do tworzenia nukleosomów ?

mitoza

zależne od replikacji

faza

G 2

faza

konstytutywne

zastępcze histony

faza S

M faza G 1

faza S

faza G 2

u wszystkich eukariota H3.3, u roślin wysoce zacetylowany H3.2

aktywna transkrypcja przez pol II RNA powoduje rozpad nukleosomów

Kulaeva i in. 2007 Mutat Res 618: 116-129

dynamika struktury

chromatyny

• w obrębie wysp CpG jest zależna od stanu metylacji DNA

• modyfikacje histonów - „kod histonowy”

• remodelowanie chromatyny

* zależne od ATP

* niekiedy za pośrednictwem interferencji RNA (RNAi)

NOBEL 2006 !

przykłady zależnej od RNA heterochromatynizacji:

- wyciszenie centromerów i loci typu koniugacyjnego u droż-

dży rozszczepkowych Schizosaccharomycespombe

- inaktywacja piętnowanego chromosomu X (Xi),

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika: